MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 43083

< Previous12...75767778798081828384858687Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_020834	AAT	2	6	2539998	2540003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337773
43002	NC_020834	ACTA	2	8	2540115	2540122	50 %	25 %	0 %	25 %	472337773
43003	NC_020834	TGC	2	6	2540322	2540327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472337773
43004	NC_020834	ATCA	2	8	2540334	2540341	50 %	25 %	0 %	25 %	472337773
43005	NC_020834	AGC	2	6	2540343	2540348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472337773
43006	NC_020834	TAAA	2	8	2540400	2540407	75 %	25 %	0 %	0 %	472337773
43007	NC_020834	TGGC	2	8	2540437	2540444	0 %	25 %	50 %	25 %	472337773
43008	NC_020834	TGCC	2	8	2540537	2540544	0 %	25 %	25 %	50 %	472337773
43009	NC_020834	TAA	2	6	2540639	2540644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337773
43010	NC_020834	ACC	2	6	2540655	2540660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472337773
43011	NC_020834	CCG	2	6	2540726	2540731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472337773
43012	NC_020834	CGTC	2	8	2540746	2540753	0 %	25 %	25 %	50 %	472337773
43013	NC_020834	TGCTTT	2	12	2540772	2540783	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	472337773
43014	NC_020834	T	6	6	2540885	2540890	0 %	100 %	0 %	0 %	472337773
43015	NC_020834	TGA	2	6	2541136	2541141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337774
43016	NC_020834	ACA	2	6	2541176	2541181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472337774
43017	NC_020834	TC	3	6	2541197	2541202	0 %	50 %	0 %	50 %	472337774
43018	NC_020834	ATTT	2	8	2541234	2541241	25 %	75 %	0 %	0 %	472337774
43019	NC_020834	CTG	2	6	2541258	2541263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472337774
43020	NC_020834	TCA	2	6	2541311	2541316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337774
43021	NC_020834	TACA	2	8	2541385	2541392	50 %	25 %	0 %	25 %	472337774
43022	NC_020834	ATA	2	6	2541489	2541494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337774
43023	NC_020834	TGA	2	6	2541514	2541519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337774
43024	NC_020834	GAT	2	6	2541538	2541543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337774
43025	NC_020834	ATCT	2	8	2541546	2541553	25 %	50 %	0 %	25 %	472337774
43026	NC_020834	AGC	2	6	2541556	2541561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472337774
43027	NC_020834	CAAT	2	8	2541599	2541606	50 %	25 %	0 %	25 %	472337774
43028	NC_020834	ATC	2	6	2541619	2541624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337774
43029	NC_020834	GCC	2	6	2541681	2541686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472337774
43030	NC_020834	GAT	2	6	2541731	2541736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337774
43031	NC_020834	TCA	2	6	2541752	2541757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337774
43032	NC_020834	CAA	3	9	2541759	2541767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472337774
43033	NC_020834	T	6	6	2541776	2541781	0 %	100 %	0 %	0 %	472337774
43034	NC_020834	AT	3	6	2541869	2541874	50 %	50 %	0 %	0 %	472337774
43035	NC_020834	GAAT	2	8	2541902	2541909	50 %	25 %	25 %	0 %	472337774
43036	NC_020834	GCC	2	6	2541940	2541945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472337774
43037	NC_020834	GAT	2	6	2541956	2541961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337774
43038	NC_020834	CAA	2	6	2541984	2541989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472337774
43039	NC_020834	T	7	7	2541997	2542003	0 %	100 %	0 %	0 %	472337774
43040	NC_020834	TAT	2	6	2542071	2542076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472337774
43041	NC_020834	TG	3	6	2542184	2542189	0 %	50 %	50 %	0 %	472337775
43042	NC_020834	A	6	6	2542493	2542498	100 %	0 %	0 %	0 %	472337775
43043	NC_020834	TAA	2	6	2542586	2542591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337775
43044	NC_020834	A	6	6	2542645	2542650	100 %	0 %	0 %	0 %	472337775
43045	NC_020834	T	6	6	2542661	2542666	0 %	100 %	0 %	0 %	472337775
43046	NC_020834	TCA	2	6	2542693	2542698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337775
43047	NC_020834	GTA	2	6	2542821	2542826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337775
43048	NC_020834	GAT	2	6	2542844	2542849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337775
43049	NC_020834	T	6	6	2542875	2542880	0 %	100 %	0 %	0 %	472337775
43050	NC_020834	ACT	2	6	2542957	2542962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337775
43051	NC_020834	AAAG	2	8	2542983	2542990	75 %	0 %	25 %	0 %	472337775
43052	NC_020834	AT	3	6	2543044	2543049	50 %	50 %	0 %	0 %	472337775
43053	NC_020834	CTT	2	6	2543066	2543071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472337775
43054	NC_020834	ATA	2	6	2543127	2543132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337775
43055	NC_020834	TGA	2	6	2543167	2543172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337775
43056	NC_020834	TAT	2	6	2543243	2543248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472337775
43057	NC_020834	A	6	6	2543335	2543340	100 %	0 %	0 %	0 %	472337775
43058	NC_020834	TGA	2	6	2543381	2543386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472337775
43059	NC_020834	AAT	2	6	2543399	2543404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337775
43060	NC_020834	GTTTC	2	10	2543533	2543542	0 %	60 %	20 %	20 %	472337776
43061	NC_020834	TGT	2	6	2543543	2543548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472337776
43062	NC_020834	AT	3	6	2543553	2543558	50 %	50 %	0 %	0 %	472337776
43063	NC_020834	CTGC	2	8	2543584	2543591	0 %	25 %	25 %	50 %	472337776
43064	NC_020834	AT	3	6	2543617	2543622	50 %	50 %	0 %	0 %	472337776
43065	NC_020834	ATCT	2	8	2543682	2543689	25 %	50 %	0 %	25 %	472337776
43066	NC_020834	T	6	6	2543737	2543742	0 %	100 %	0 %	0 %	472337776
43067	NC_020834	TAA	2	6	2543749	2543754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337776
43068	NC_020834	CCA	2	6	2543832	2543837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472337776
43069	NC_020834	ATA	2	6	2543921	2543926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472337776
43070	NC_020834	T	6	6	2543953	2543958	0 %	100 %	0 %	0 %	472337776
43071	NC_020834	TCT	2	6	2544014	2544019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472337776
43072	NC_020834	ATT	2	6	2544038	2544043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472337776
43073	NC_020834	T	7	7	2544042	2544048	0 %	100 %	0 %	0 %	472337776
43074	NC_020834	CCA	2	6	2544108	2544113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472337776
43075	NC_020834	AAAT	2	8	2544212	2544219	75 %	25 %	0 %	0 %	472337776
43076	NC_020834	ATC	2	6	2544226	2544231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337776
43077	NC_020834	ACT	2	6	2544233	2544238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472337776
43078	NC_020834	AAAG	2	8	2544239	2544246	75 %	0 %	25 %	0 %	472337776
43079	NC_020834	GAAT	2	8	2544282	2544289	50 %	25 %	25 %	0 %	472337776
43080	NC_020834	ATT	2	6	2544316	2544321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472337776
43081	NC_020834	CTG	2	6	2544322	2544327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472337776
43082	NC_020834	T	7	7	2544397	2544403	0 %	100 %	0 %	0 %	472337776
43083	NC_020834	A	6	6	2544451	2544456	100 %	0 %	0 %	0 %	472337776

< Previous12...75767778798081828384858687Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.